MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG4

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011563	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550315
2	NC_011563	A	8	8	64	71	100 %	0 %	0 %	0 %	212550315
3	NC_011563	TGC	2	6	77	82	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550315
4	NC_011563	T	6	6	198	203	0 %	100 %	0 %	0 %	212550315
5	NC_011563	GAAC	2	8	227	234	50 %	0 %	25 %	25 %	212550315
6	NC_011563	CGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550315
7	NC_011563	AG	3	6	291	296	50 %	0 %	50 %	0 %	212550315
8	NC_011563	CGA	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550315
9	NC_011563	AAATT	2	10	394	403	60 %	40 %	0 %	0 %	212550315
10	NC_011563	A	6	6	429	434	100 %	0 %	0 %	0 %	212550315
11	NC_011563	CCG	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212550315
12	NC_011563	TCCAA	2	10	551	560	40 %	20 %	0 %	40 %	212550315
13	NC_011563	CCCG	2	8	624	631	0 %	0 %	25 %	75 %	212550315
14	NC_011563	AAC	2	6	754	759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550315
15	NC_011563	GAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550315
16	NC_011563	CTGA	2	8	895	902	25 %	25 %	25 %	25 %	212550315
17	NC_011563	A	7	7	1067	1073	100 %	0 %	0 %	0 %	212550315
18	NC_011563	TGA	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550316
19	NC_011563	T	6	6	1188	1193	0 %	100 %	0 %	0 %	212550316
20	NC_011563	TCA	3	9	1195	1203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550316
21	NC_011563	TCTTT	2	10	1243	1252	0 %	80 %	0 %	20 %	212550316
22	NC_011563	CCG	2	6	1276	1281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212550316
23	NC_011563	T	8	8	1315	1322	0 %	100 %	0 %	0 %	212550316
24	NC_011563	T	6	6	1338	1343	0 %	100 %	0 %	0 %	212550316
25	NC_011563	GCGTTC	2	12	1344	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550316
26	NC_011563	T	7	7	1386	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	212550316
27	NC_011563	TCC	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550316
28	NC_011563	GTA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550316
29	NC_011563	TAC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550316
30	NC_011563	AT	3	6	1589	1594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011563	TA	5	10	1634	1643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011563	TA	4	8	1645	1652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011563	TG	3	6	1662	1667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011563	AGCA	2	8	1699	1706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011563	ATA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550317
36	NC_011563	CGG	2	6	1815	1820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212550317
37	NC_011563	GCC	3	9	1823	1831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212550317
38	NC_011563	A	6	6	1951	1956	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
39	NC_011563	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550317
40	NC_011563	AAAAC	2	10	2050	2059	80 %	0 %	0 %	20 %	212550317
41	NC_011563	A	6	6	2074	2079	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
42	NC_011563	TCT	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550317
43	NC_011563	A	6	6	2296	2301	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
44	NC_011563	CCA	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550317
45	NC_011563	TCA	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550317
46	NC_011563	GAAA	2	8	2426	2433	75 %	0 %	25 %	0 %	212550317
47	NC_011563	A	7	7	2431	2437	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
48	NC_011563	A	6	6	2475	2480	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
49	NC_011563	TATAAA	2	12	2497	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550317
50	NC_011563	AAC	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550317
51	NC_011563	AAC	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550317
52	NC_011563	CCG	2	6	2577	2582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212550317
53	NC_011563	A	7	7	2704	2710	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
54	NC_011563	A	6	6	2804	2809	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
55	NC_011563	A	8	8	2844	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
56	NC_011563	A	6	6	2871	2876	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
57	NC_011563	A	7	7	2903	2909	100 %	0 %	0 %	0 %	212550317
58	NC_011563	GCC	2	6	2951	2956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212550317
59	NC_011563	CAA	3	9	2990	2998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550317
60	NC_011563	CA	3	6	3021	3026	50 %	0 %	0 %	50 %	212550317
61	NC_011563	GCG	2	6	3115	3120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011563	CGG	2	6	3130	3135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011563	A	6	6	3346	3351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011563	AATA	2	8	3412	3419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011563	GCG	2	6	3435	3440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011563	TGC	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011563	TTGT	2	8	3493	3500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011563	ATA	2	6	3510	3515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011563	G	6	6	3789	3794	0 %	0 %	100 %	0 %	212550318
70	NC_011563	T	8	8	3844	3851	0 %	100 %	0 %	0 %	212550318
71	NC_011563	AT	3	6	3907	3912	50 %	50 %	0 %	0 %	212550318
72	NC_011563	A	6	6	3937	3942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011563	T	6	6	4018	4023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011563	ATTT	2	8	4073	4080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011563	ATTT	2	8	4105	4112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.